不同的学校院系，不同的指导教师对计算机专业毕业设计有不同的指导方法，在计算机系，本科毕业设计通常以下面四种类型：1完成一个不太大的实际项目或在某一个较大的项目中设计并完成一个模块（如应用软件、工具软件或自行设计的板卡、接口等等），然后以工程项目总结或科研报告、或已发表的论文的综合扩展等形式完成设计与论文的写作。2 对一个即将进行的项目的一部份进行系统分析（需求分析，平台选型，分块，设计部分模块的细化）。例如对一个大中型企业管理信息系统中的财务部分进行调研，分析和设计等，这类工作可以没有具体编程，但应得到有关方面的初步认可，有一定的工作量。例如打印后有30页以上的报告。3 对某一项计算机领域的先进技术或成熟软件进行分析、比较，进而能提出自己的评价和有针对性创见。例如xml目前是因特网上新涌现的标记语言，它较html有许多无可比拟的优点，其中xml-ql是基于xml提出的一种新型查询语言，分析总结这一新型查询语言并探索它的实现途径是十分有意义的工作。再如对自由软件数据库系统mysql，分析总结其在web应用上的特色，并能将有关技术用于自己研制的系统中。这类工作要注意把分析和实验相结合，不要只停留在消化上。消化是前提，吸收和转化才是工作的重点。4 对某一个计算机科学中的理论问题有一定见解，接近或达到了在杂志上发表的水平。例如，解决了一个众所周知的问题，纠正了某杂志上理论的错误且提出解决修正方案，或自己提出有意义的模型，定义，且有定理、命题、或性能比较、分析、测试报告等。 一般第四种较难。
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