随着抗菌药物广泛、大量在临床应用，从而也导致了抗生素的滥用。因此，限制和禁止抗菌药物在缺乏用药指征者的应用，是防止和杜绝抗菌药物滥用的重要措施之一。
1．病毒感染上呼吸道感染主要为病毒性感染，常见的如感冒、流感等，应用抗菌药物治疗无效。即便有细菌感染，也多为自限型的，如急性中耳炎自愈率高达90％以上；而急性鼻窦炎自愈率亦在70％左右。因此，急性鼻炎、喉炎、气管炎只是病毒感染，则不需用抗菌药物治疗。扁桃体炎可能为链球菌感染，也只要用青霉素治疗即可。同样，婴幼儿秋冬季腹泻和春季流行性腹泻，多由病毒感染所致，所以不能随意自行服用抗菌药物，应及时就医对症用药。
2．发热原因不明者热型是诊断疾病的依据之一，对于发热原因不明者，除病情严重并怀疑为细菌感染者外，一般不宜用抗菌药物，以免临床症状不典型和病原菌不易被检出，延误正确诊断和治疗。
3．一些腹泻、肠炎者痢疾和部分由大肠埃希菌感染引起的肠炎确诊后的细菌感染，应当应用抗菌药物治疗；然而，腹泻未必都是细菌感染所致，腹部受凉引起肠蠕动加快，对乳制品、鱼虾等食物过敏引起的变态反应；胰腺外分泌功能不足，甚至胰腺癌等都会引起腹泻，此类腹泻没有细菌感染，木应选用抗菌药物治疗。
4．皮肤和黏膜应尽量不在皮肤和黏膜局部应用抗菌药物，尤其青霉素等应禁用，头孢菌素应慎用。因为局部用药易使细菌产生耐药性和过敏反应。新霉素、磺胺醋酰钠、杆菌肽、莫匹罗星等专供皮肤和黏膜局部应用的抗菌药物，在治疗中确需局部用药才可选用。
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